Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Basp1Q91XV3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms