Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms