Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhdc3Q8VEM9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms