Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VDP2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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