Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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