Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg2Q8VCK3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms