Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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