Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms