Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorbQ8R1B8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms