Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms