Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms