Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms