Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms