Protein–RNA interactions for Protein: Q8K072

Reep4, Receptor expression-enhancing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep4Q8K072 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep4Q8K072 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep4Q8K072 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms