Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l2Q8JZQ2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms