Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf628Q8CJ78 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Znf628Q8CJ78 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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