Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms