Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC62

Teddm1b, MCG53738, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm1bQ8CC62 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Teddm1bQ8CC62 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Teddm1bQ8CC62 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms