Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fbxo48Q8CAT8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms