Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms