Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ssuh2Q8C3L1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms