Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trerf1Q8BXJ2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trerf1Q8BXJ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms