Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Pggt1bQ8BUY9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Pggt1bQ8BUY9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Pggt1bQ8BUY9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Pggt1bQ8BUY9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Pggt1bQ8BUY9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Pggt1bQ8BUY9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Pggt1bQ8BUY9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms