Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms