Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms