Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms