Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms