Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra5Q8BHJ7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms