Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms