Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Vipas39Q8BGQ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Vipas39Q8BGQ1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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