Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.2Q85ZW9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms