Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms