Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Lrrc27Q80YS5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Lrrc27Q80YS5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc27Q80YS5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc27Q80YS5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc27Q80YS5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc27Q80YS5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc27Q80YS5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc27Q80YS5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc27Q80YS5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc27Q80YS5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc27Q80YS5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc27Q80YS5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc27Q80YS5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc27Q80YS5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc27Q80YS5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms