Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms