Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms