Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms