Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms