Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efr3bQ6ZQ18 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Efr3bQ6ZQ18 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efr3bQ6ZQ18 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efr3bQ6ZQ18 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Efr3bQ6ZQ18 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Efr3bQ6ZQ18 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms