Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis3Q6XP49 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis3Q6XP49 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms