Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms