Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms