Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc3bQ6PDC0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms