Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms