Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp200Q6P4T2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms