Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1I3

KICSTOR complex protein C12orf66 homolog, mousemouse

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P1I3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P1I3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P1I3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P1I3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms