Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxip1Q6NZQ4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxip1Q6NZQ4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms