Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms