Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms