Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pram1Q6BCL1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pram1Q6BCL1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pram1Q6BCL1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pram1Q6BCL1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pram1Q6BCL1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pram1Q6BCL1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pram1Q6BCL1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pram1Q6BCL1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pram1Q6BCL1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms