Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms